MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia amylovora ATCC 49946 plasmid 2

Total Repeats: 1299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013973	ATT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386420
2	NC_013973	GAA	2	6	245	250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386420
3	NC_013973	A	7	7	249	255	100 %	0 %	0 %	0 %	293386420
4	NC_013973	CGC	2	6	607	612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386421
5	NC_013973	CG	3	6	689	694	0 %	0 %	50 %	50 %	293386421
6	NC_013973	CAC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386421
7	NC_013973	GC	3	6	955	960	0 %	0 %	50 %	50 %	293386421
8	NC_013973	ACG	2	6	1004	1009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386421
9	NC_013973	TGC	3	9	1010	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386421
10	NC_013973	AGC	2	6	1037	1042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386421
11	NC_013973	ACCGCG	2	12	1061	1072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	293386421
12	NC_013973	CTGA	2	8	1111	1118	25 %	25 %	25 %	25 %	293386421
13	NC_013973	CTT	2	6	1122	1127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386421
14	NC_013973	CG	3	6	1133	1138	0 %	0 %	50 %	50 %	293386421
15	NC_013973	GGA	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293386421
16	NC_013973	TCA	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386421
17	NC_013973	CCA	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386421
18	NC_013973	GTC	2	6	1321	1326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386421
19	NC_013973	TGCG	2	8	1337	1344	0 %	25 %	50 %	25 %	293386421
20	NC_013973	AGC	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386421
21	NC_013973	CGA	2	6	1463	1468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386421
22	NC_013973	ACC	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386421
23	NC_013973	TGC	2	6	1568	1573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386421
24	NC_013973	GC	3	6	1578	1583	0 %	0 %	50 %	50 %	293386421
25	NC_013973	AAAG	2	8	1902	1909	75 %	0 %	25 %	0 %	293386422
26	NC_013973	CT	3	6	1945	1950	0 %	50 %	0 %	50 %	293386422
27	NC_013973	GT	3	6	2020	2025	0 %	50 %	50 %	0 %	293386422
28	NC_013973	A	6	6	2505	2510	100 %	0 %	0 %	0 %	293386423
29	NC_013973	GTG	2	6	2620	2625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386423
30	NC_013973	A	6	6	2701	2706	100 %	0 %	0 %	0 %	293386424
31	NC_013973	GCC	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386424
32	NC_013973	GGA	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293386424
33	NC_013973	ATGA	2	8	2836	2843	50 %	25 %	25 %	0 %	293386424
34	NC_013973	GGT	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386425
35	NC_013973	A	6	6	3138	3143	100 %	0 %	0 %	0 %	293386425
36	NC_013973	GAT	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386425
37	NC_013973	ACA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386425
38	NC_013973	GA	3	6	3255	3260	50 %	0 %	50 %	0 %	293386425
39	NC_013973	GAT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386426
40	NC_013973	A	6	6	3573	3578	100 %	0 %	0 %	0 %	293386427
41	NC_013973	GCAC	2	8	3643	3650	25 %	0 %	25 %	50 %	293386427
42	NC_013973	A	6	6	3679	3684	100 %	0 %	0 %	0 %	293386427
43	NC_013973	CGGT	2	8	3720	3727	0 %	25 %	50 %	25 %	293386427
44	NC_013973	A	6	6	3782	3787	100 %	0 %	0 %	0 %	293386428
45	NC_013973	CGG	2	6	3855	3860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386428
46	NC_013973	GCGCG	2	10	3863	3872	0 %	0 %	60 %	40 %	293386428
47	NC_013973	GGCGCT	2	12	3891	3902	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	293386428
48	NC_013973	CTG	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386428
49	NC_013973	GGC	2	6	3998	4003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386428
50	NC_013973	CGG	2	6	4029	4034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386428
51	NC_013973	GGC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386428
52	NC_013973	GTG	2	6	4117	4122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386428
53	NC_013973	GAC	3	9	4147	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386428
54	NC_013973	AGC	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386428
55	NC_013973	CGA	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386428
56	NC_013973	AGG	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293386428
57	NC_013973	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386428
58	NC_013973	CCCGC	2	10	4227	4236	0 %	0 %	20 %	80 %	293386428
59	NC_013973	GCG	2	6	4266	4271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386428
60	NC_013973	GGC	3	9	4371	4379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386428
61	NC_013973	CAC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386428
62	NC_013973	GCA	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386428
63	NC_013973	GAT	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386428
64	NC_013973	ACG	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386428
65	NC_013973	CG	3	6	4596	4601	0 %	0 %	50 %	50 %	293386428
66	NC_013973	TGC	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386428
67	NC_013973	A	7	7	4877	4883	100 %	0 %	0 %	0 %	293386429
68	NC_013973	AAC	2	6	4898	4903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386429
69	NC_013973	CTCC	2	8	4934	4941	0 %	25 %	0 %	75 %	293386429
70	NC_013973	GGC	2	6	4945	4950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386429
71	NC_013973	TGC	2	6	5006	5011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386429
72	NC_013973	ATG	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386429
73	NC_013973	G	8	8	5586	5593	0 %	0 %	100 %	0 %	293386430
74	NC_013973	A	6	6	5601	5606	100 %	0 %	0 %	0 %	293386430
75	NC_013973	T	6	6	5628	5633	0 %	100 %	0 %	0 %	293386430
76	NC_013973	A	6	6	5639	5644	100 %	0 %	0 %	0 %	293386430
77	NC_013973	GTAAT	2	10	5954	5963	40 %	40 %	20 %	0 %	293386431
78	NC_013973	GTC	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386431
79	NC_013973	CG	3	6	6032	6037	0 %	0 %	50 %	50 %	293386431
80	NC_013973	TTA	2	6	6057	6062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386431
81	NC_013973	T	7	7	6117	6123	0 %	100 %	0 %	0 %	293386431
82	NC_013973	TGC	2	6	6256	6261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386432
83	NC_013973	TCG	2	6	6323	6328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386432
84	NC_013973	TTA	2	6	6395	6400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386432
85	NC_013973	TGA	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386432
86	NC_013973	TG	3	6	6590	6595	0 %	50 %	50 %	0 %	293386433
87	NC_013973	TCT	2	6	6643	6648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386433
88	NC_013973	TTCA	2	8	6672	6679	25 %	50 %	0 %	25 %	293386433
89	NC_013973	ACA	2	6	6775	6780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293386433
90	NC_013973	CTG	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386433
91	NC_013973	TCA	2	6	7006	7011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386433
92	NC_013973	ATG	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386433
93	NC_013973	CTT	2	6	7032	7037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386433
94	NC_013973	AAT	2	6	7113	7118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293386433
95	NC_013973	CAT	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386433
96	NC_013973	TTA	2	6	7356	7361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386434
97	NC_013973	GACG	2	8	7525	7532	25 %	0 %	50 %	25 %	293386434
98	NC_013973	ATC	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386434
99	NC_013973	GCG	3	9	7654	7662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386434
100	NC_013973	ATG	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386434
101	NC_013973	TAA	2	6	7720	7725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293386434
102	NC_013973	ACG	2	6	7760	7765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386434
103	NC_013973	TCCT	2	8	7785	7792	0 %	50 %	0 %	50 %	293386434
104	NC_013973	GCC	2	6	7807	7812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386434
105	NC_013973	CTG	2	6	7893	7898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386434
106	NC_013973	TGG	3	9	7902	7910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386434
107	NC_013973	CAGC	2	8	7940	7947	25 %	0 %	25 %	50 %	293386434
108	NC_013973	T	6	6	7980	7985	0 %	100 %	0 %	0 %	293386434
109	NC_013973	GCT	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386434
110	NC_013973	CTGG	2	8	8090	8097	0 %	25 %	50 %	25 %	293386434
111	NC_013973	CGC	2	6	8150	8155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386434
112	NC_013973	TCG	2	6	8329	8334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386434
113	NC_013973	TTC	2	6	8364	8369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293386434
114	NC_013973	TGA	2	6	8418	8423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386434
115	NC_013973	CTG	2	6	8448	8453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386434
116	NC_013973	CCGG	2	8	8573	8580	0 %	0 %	50 %	50 %	293386434
117	NC_013973	CCG	2	6	8815	8820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386435
118	NC_013973	CGA	2	6	8833	8838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386435
119	NC_013973	CAT	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386435
120	NC_013973	AG	3	6	8943	8948	50 %	0 %	50 %	0 %	293386435
121	NC_013973	T	7	7	9064	9070	0 %	100 %	0 %	0 %	293386435
122	NC_013973	AT	3	6	9289	9294	50 %	50 %	0 %	0 %	293386436
123	NC_013973	TGA	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386436
124	NC_013973	ACT	2	6	9539	9544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386436
125	NC_013973	ACG	2	6	9607	9612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386436
126	NC_013973	A	6	6	9648	9653	100 %	0 %	0 %	0 %	293386436
127	NC_013973	CAGC	2	8	9746	9753	25 %	0 %	25 %	50 %	293386436
128	NC_013973	TCG	2	6	9949	9954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386436
129	NC_013973	CGT	2	6	9972	9977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386436
130	NC_013973	ATG	2	6	10009	10014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386436
131	NC_013973	TCG	2	6	10123	10128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386436
132	NC_013973	GTG	3	9	10129	10137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386436
133	NC_013973	ATT	2	6	10191	10196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293386436
134	NC_013973	AAG	2	6	10270	10275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386437
135	NC_013973	GAT	2	6	10304	10309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386437
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137	NC_013973	CG	3	6	10356	10361	0 %	0 %	50 %	50 %	293386437
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246	NC_013973	A	6	6	16897	16902	100 %	0 %	0 %	0 %	293386451
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261	NC_013973	CTG	2	6	17599	17604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386452
262	NC_013973	CTGC	2	8	17626	17633	0 %	25 %	25 %	50 %	293386452
263	NC_013973	G	6	6	17656	17661	0 %	0 %	100 %	0 %	293386452
264	NC_013973	CTG	2	6	17683	17688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386452
265	NC_013973	GCA	2	6	17699	17704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386452
266	NC_013973	TTGCCG	2	12	17750	17761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386452
267	NC_013973	AGGA	2	8	17837	17844	50 %	0 %	50 %	0 %	293386452
268	NC_013973	ACG	2	6	17951	17956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386452
269	NC_013973	GCC	2	6	18028	18033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386452
270	NC_013973	CAG	2	6	18037	18042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386452
271	NC_013973	TTG	2	6	18086	18091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293386452
272	NC_013973	GGC	2	6	18154	18159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386452
273	NC_013973	GGC	2	6	18190	18195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293386452
274	NC_013973	CGC	2	6	18310	18315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386452
275	NC_013973	ACG	2	6	18317	18322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386452
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277	NC_013973	TGA	2	6	18438	18443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386452
278	NC_013973	GCC	2	6	18484	18489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386452
279	NC_013973	GTG	2	6	18532	18537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293386452
280	NC_013973	GCGTG	2	10	18570	18579	0 %	20 %	60 %	20 %	293386452
281	NC_013973	GAAAGC	2	12	18589	18600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	293386452
282	NC_013973	GAACG	2	10	18618	18627	40 %	0 %	40 %	20 %	293386452
283	NC_013973	GCT	2	6	18684	18689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293386452
284	NC_013973	GCA	2	6	18738	18743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386452
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286	NC_013973	TAC	2	6	18805	18810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293386452
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289	NC_013973	CCG	2	6	18937	18942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293386452
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291	NC_013973	ACC	2	6	19103	19108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293386452
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293	NC_013973	TTG	2	6	19169	19174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293386452
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301	NC_013973	GC	4	8	19501	19508	0 %	0 %	50 %	50 %	293386453
302	NC_013973	AC	3	6	20164	20169	50 %	0 %	0 %	50 %	293386454
303	NC_013973	AACGTC	2	12	20172	20183	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	293386454
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321	NC_013973	GCTAT	2	10	21149	21158	20 %	40 %	20 %	20 %	293386456
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325	NC_013973	GCA	2	6	22087	22092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293386457
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329	NC_013973	TGA	2	6	22395	22400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386457
330	NC_013973	GAA	2	6	22414	22419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386457
331	NC_013973	AGCC	2	8	22476	22483	25 %	0 %	25 %	50 %	293386457
332	NC_013973	A	7	7	22529	22535	100 %	0 %	0 %	0 %	293386457
333	NC_013973	TCC	2	6	22822	22827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293386458
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369	NC_013973	AACT	2	8	24845	24852	50 %	25 %	0 %	25 %	293386461
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380	NC_013973	AGCA	2	8	25506	25513	50 %	0 %	25 %	25 %	293386461
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385	NC_013973	CG	4	8	25689	25696	0 %	0 %	50 %	50 %	293386461
386	NC_013973	CTGG	2	8	25714	25721	0 %	25 %	50 %	25 %	293386461
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388	NC_013973	ATG	2	6	25915	25920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293386461
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392	NC_013973	GAA	2	6	26036	26041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293386461
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